Das in sechs Jahren entstandene Lebenswerk Heckels umfasst ca. 1100 Gemälde, von denen allerdings der größere Teil vor allem des Frühwerks zerstört oder verschollen ist.

Der Oeuvre-Katalog der Druckgraphik weist 484 Holzschnitte, 403 Lithographien und 199 Radierungen aus.

Für Aquarelle, Zeichnungen oder Skizzen gibt es kein Werkverzeichnis. Da mehrere Tausend Papierarbeiten bekannt sind, wird es auch künftig kein publiziertes Verzeichnis geben können; zudem gilt eine unbekannte Anzahl als zerstört oder verschollen.

Der von der Nachlassverwaltung angelegte interne Werk-Katalog wird laufend ergänzt. – Vor allem aus der Zeit vor 1909 haben sich nur ganz wenige Blätter erhalten.

Atelierfotos, Briefe und Darstellungen Heckels Bildern bezeugen, dass wesentlich mehr Holzskulpturen entstanden sind, als die sieben, die heute noch existieren. Die älteste erhaltene aus dem Jahr 1906 befindet sich im Hamburger Museum für Kunst und Gewerbe, die späteste von 1920 in den Kunstsammlungen Chemnitz.

Im Folgenden wurde aus den verschiedenen Gattungen jeweils eine kleine Auswahl aus allen Schaffensphasen, die wichtigsten Motivgruppen berücksichtigend, zusammengestellt.